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非天然糖核苷酸的合成及其應(yīng)用
盡管自然界中的碳水化合物和糖復(fù)合物結(jié)構(gòu)十分復(fù)雜,但人的糖蛋白和糖脂僅有九種構(gòu)成單元:葡萄糖(glucose, Glc)、半乳糖(galactose, Gal)、N-乙酰氨基葡萄糖(N-acetylglucosamine, GlcNAc)、N-乙酰氨基半乳糖(N-acetylgalactosamine, GalNAc)、葡萄糖醛酸(glucuronic acid, GlcA)、木糖(xylose, Xyl)、甘露糖(mannose, Man)、巖藻糖(fucose, Fuc)和N-乙酰神經(jīng)氨酸(N-acetylneuraminic acid, Neu5Ac)(如圖1[1]。這些構(gòu)成單元必須被活化為糖核苷酸后,才能參與到不同糖鏈的構(gòu)建中[2, 3]。

糖核苷酸在結(jié)構(gòu)上可分為兩類:核苷二磷酸(nucleoside diphosphate, NDP)糖和核苷一磷酸(nucleoside monophosphate, NMP)糖,其中NDP-糖最為常見。尿苷二磷酸(uridine diphosphate, UDP)單糖是最常見的NDP-糖供體,在多糖生物合成途徑中,它們能夠被糖基轉(zhuǎn)移酶或者合酶轉(zhuǎn)移到糖基受體上構(gòu)建糖苷鍵。
天然和非天然UDP-糖都能夠通過化學(xué)、酶法和化學(xué)酶法來合成[4-7]。雖然已有很多文獻(xiàn)報道了天然UDP-糖的合成方法,但是目前針對非天然UDP-糖的合成和應(yīng)用的探索還相對匱乏。這些非天然糖基供體有很大的應(yīng)用前景,可作為酶底物用于功能性多糖和糖復(fù)合物的合成、酶抑制劑研究以及各種活性測試[4, 8]。因此,非天然糖核苷酸的合成在過去十年間一直都是研究熱點(diǎn)。Wagner等人總結(jié)了從1999年到2009NDP-糖、NMP-糖及其衍生物的化學(xué)合成進(jìn)展[4],Thorson等人在2011年發(fā)表的有關(guān)糖基化的文章中詳細(xì)總結(jié)了糖核苷酸的酶促合成途徑(尤其是包括端基異構(gòu)激酶和焦磷酸化酶的合成方法)及其底物和酶催化的轉(zhuǎn)化[9]。
這里,我們總結(jié)了非天然糖核苷酸,特別是尿苷二磷酸乙酰氨基葡萄糖(uridine diphosphate-N-acetylglucosamine, UDP-GlcNAc/尿苷二磷酸乙酰氨基半乳糖(uridine diphosphate-N-acetylgalactosamine, UDP-GalNAc)類似物的化學(xué)法、酶促法和化學(xué)酶法制備方面的進(jìn)展,及其在生理和藥理學(xué)方面的生物技術(shù)應(yīng)用。由于很難通過修飾天然糖核苷酸來獲得非天然糖核苷酸[4],目前研究中主要由兩步法合成策略來實現(xiàn)非天然糖基供體的合成:第一步是糖-1-磷酸(sugar-1-P)的合成,可以在此階段實現(xiàn)結(jié)構(gòu)的衍生化;第二步是二磷酸鍵的形成。同時,我們也介紹了糖核苷酸在過去十年中的新應(yīng)用,包括碳鏈長度可控多糖的合成,穩(wěn)定的同位素標(biāo)記技術(shù),酶促和代謝生物正交策略以及結(jié)構(gòu)-活性關(guān)系(structure activity relationships, SAR)研究等。

1. 常見糖核苷酸

1    糖核苷酸的合成

常見的糖核苷酸中的大多數(shù)共有相似的生物合成途徑,即由6-磷酸葡萄糖和6-磷酸果糖作為關(guān)鍵中間體,以激酶和核苷酸轉(zhuǎn)移酶作為關(guān)鍵酶。GlcNAcGalNAc是很多重要多糖或糖復(fù)合物(比如糖胺聚糖(glycosaminoglycans, GAGs))的基本構(gòu)成單元,所以對它們相應(yīng)的核苷酸供體(即UDP-GlcNAcUDP-GalNAc)的研究最為廣泛[10,11]。在生物合成途徑中,通常是由酶催化葡萄糖(de novo pathway)或GlcNAc/GalNAcsalvage pathways)生成糖環(huán)1-位單磷酸化的中間產(chǎn)物GlcNAc-1-磷酸(GlcNAc-1-P),再對GlcNAc-1-P進(jìn)行酶促焦磷酸化從而合成二磷酸供體UDP-GlcNAc[12]。UDP-GlcNAc/GalNAc的生物合成也可被進(jìn)一步簡化:用6-激酶將糖轉(zhuǎn)化為的糖-6-P,糖-6-P再經(jīng)變位酶轉(zhuǎn)化為糖-1-P,糖-1-P緊接著被尿苷三磷酸(UTP)焦磷酸化得到UDP-糖(如圖2[5]

2. UDP-GlcNAc/GalNAc的生物合成途徑

根據(jù)生物合成途徑得知,核苷二磷酸糖合成的關(guān)鍵步驟是在核苷的5'-OH位和糖的異頭羥基之間引入焦磷酸基團(tuán)(如圖3[4]。目前研究中常用兩種途徑進(jìn)行合成,第一種方法是將含離去基團(tuán)的糖基供體(如鹵化物)和核苷5'-二磷酸直接進(jìn)行糖基化(如圖3path A)。但這種方法較難控制糖苷鍵的立體選擇性。第二種方法是KhoranaMoffat開發(fā)的,目前更流行(如圖3,path B):耦合單糖-1-磷酸和活化的核苷5'-單磷酸鹽(如核苷磷酸嗎啡酸鹽)來構(gòu)建焦磷酸鍵,最終產(chǎn)物的糖苷鍵構(gòu)型可以通過糖-1-磷酸的立體選擇性來控制[13,14]

3. UDP-糖的一般合成途徑

1.1    α-連接構(gòu)型的糖-1-磷酸的合成

一般而言,控制糖-1-P的立體構(gòu)型,再將其與活化的核苷5'-單磷酸酯偶聯(lián),可以控制UDP-糖基供體糖環(huán)和焦磷酸部分之間的糖苷鍵構(gòu)型。到目前為止,對α-連接構(gòu)型的糖-1-磷酸的合成方法的研究較為深入。

1.1.1    麥克唐納反應(yīng)(MacDonald reaction

麥克唐納反應(yīng)是一種用于糖的單磷酸化的經(jīng)典方法,反應(yīng)過程是全乙?;Wo(hù)的單糖與磷酸在真空下進(jìn)行的化學(xué)反應(yīng),以高選擇性生成α-連接構(gòu)型的糖-1-磷酸[15]。在這個反應(yīng)的基礎(chǔ)上,Masuko等人以30%-50%的產(chǎn)率構(gòu)建了一個小型非天然GlcNAc-1-PGlcNAc-1-P衍生物庫(如圖4[16]。他們也證實了疊氮基和炔基在這種酸性條件下較穩(wěn)定,因此,可以進(jìn)一步通過點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)進(jìn)行熒光基團(tuán)標(biāo)記。
UDP-三氟乙酰氨基葡萄糖(UDP-GlcNTFA)是在化學(xué)酶法合成硫酸乙酰肝素和肝素中一種常用的糖基供體,而在麥克唐納反應(yīng)的條件下三氟乙酰氨基也很穩(wěn)定,所以也可以利用該反應(yīng)合成α-連接構(gòu)型GlcNTFA-1-P[17]。該方法也可用于其他糖核苷酸的合成,如α-D-阿拉伯呋喃糖-1-磷酸(α-D-arabinofuranose-1-phosphate, Ara-1-P[18]、3-脫氧-α-D-阿拉伯己糖-1-磷酸[19]2-脫氧-α-D-葡萄糖-1-磷酸[19]。然而,麥克唐納反應(yīng)的反應(yīng)條件較為苛刻,一般不適用于熱穩(wěn)定性差的糖的合成,而且其產(chǎn)率普遍偏低,這限制了該方法進(jìn)一步的應(yīng)用[4]。

4. 通過麥克唐納反應(yīng)合成GlcNAc/GalNAc-1-磷酸類似物

1.1.2    對半縮醛羥基進(jìn)行磷酸化反應(yīng)

對糖環(huán)半縮醛羥基C-1-OH直接進(jìn)行磷酸化是另一種構(gòu)建α-構(gòu)型糖-1-P的有效方法。半縮醛羥基和磷酸化試劑反應(yīng)后能獲得保護(hù)基保護(hù)的α-構(gòu)型單磷酸,然后經(jīng)過催化加氫即可將磷酸鹽上的保護(hù)基團(tuán)去除,獲得α-連接構(gòu)型糖-1-P。SabesanNeira等人通過4-二甲基氨基吡啶(4-dimethylaminopyridine, DMAP)催化糖半縮醛和二苯基膦酰氯耦合構(gòu)建了α-糖苷鍵[20]。Dinev等人用同樣方法制備了13C標(biāo)記的全乙?;咸烟?/span>-1-磷酸,其產(chǎn)率為83%(如圖5-I)[21]。Schultz等人在二異丙基氨基鋰(lithium diisopropylamide, LDA)存在下用四芐基焦磷酸進(jìn)行磷酸化,生成了高α-選擇性的磷酸化產(chǎn)物(如圖5-II[22,23]。他們發(fā)現(xiàn)氟、疊氮基在這種條件下也很穩(wěn)定,從而可以構(gòu)建氟、疊氮基修飾的非天然糖基供體。Feng等人(如圖5-III)通過三氮唑催化二芐基二乙基胺基膦(dibenzyl N,N-diethylphosphoramidite, DDP)與半縮醛,生成亞磷酸鹽,隨后氧化得到糖-1-P。雖然此反應(yīng)沒有立體選擇性,產(chǎn)物為αβ混合物(α:β=1:1[24],但后續(xù)在四氫呋喃中用叔丁基過氧化氫(t-BuOOH)處理這兩種異構(gòu)體時,β-構(gòu)型的產(chǎn)物能快速異構(gòu)化為α-異構(gòu)體。但是,在選擇氧化劑時,如果使用過氧化氫(H2O2),會破壞O-P鍵生成副產(chǎn)物。同樣,Graziani等用雙(芐氧基)-N,N-二異丙基氨基-磷化氫/1H-四唑成功合成了GDP-D-甘油-α-D-甘露庚糖,然后用叔丁基過氧化氫(tert-Butyl hydroperoxide, TBHP)氧化制備了關(guān)鍵的中間體α-磷酸鹽[25]。該方法還可用于合成一系列糖-1-磷酸酯,例如D-甘露糖醛酸(D-mannuronic acid, ManA-1-P[26],N-乙?;蛩幔?/span>N-acetylmuramic acid, MurNAc-1-P[27]2-脫氧-α-D-葡萄糖-1-P,3-脫氧-α-D-阿拉伯己糖-1-Pα-D-來蘇糖-1-P4-脫氧-α-D-lyxo-hexose-1-P[19]

5. 糖半縮醛和磷酸化試劑間的縮合生成α-連接異頭磷酸鹽

1.1.3    酶法途徑

由于糖核苷酸在有機(jī)溶劑中的溶解度較低,且糖苷鍵和焦磷酸鍵不耐水解,通過傳統(tǒng)化學(xué)方法合成糖核苷酸非常具有挑戰(zhàn)性。另外,在化學(xué)合成過程中通常涉及多步的保護(hù)基操作和異構(gòu)體分離純化,其過程繁瑣、產(chǎn)率低下。而酶法合成利用了酶催化的高效選擇性,能夠模擬糖苷鍵生物合成途徑,具有高立體選擇性和高區(qū)域選擇性,有廣泛的應(yīng)用前景[5]。
NahKN-acetylhexosamine kinase)是一種N-乙酰己糖胺激酶,也是第一個被報道的野生型葡萄糖型1-激酶,可以快速有效地催化GlcNAc受體和5'-三磷酸腺苷(adenosine triphosphate, ATP)磷酸供體合成GlcNAc-1-P[28]ZhaoCai等人利用這種酶成功將非天然的GlcNAc/GalNAc類似物轉(zhuǎn)換成了它們的1-磷酸化產(chǎn)物。并且他們發(fā)現(xiàn)這種酶的底物適用性非常好,無論糖環(huán)的C-4位羥基是平伏鍵或豎立鍵,都不影響酶對底物的識別(如圖6[29,30]。更重要的是,對糖底物的N-?;M(jìn)行多種正交基團(tuán)的修飾,也不影響酶的識別。因此,通過此方法可以成功將一些正交基團(tuán)標(biāo)記到糖或糖復(fù)合物結(jié)構(gòu)中去,便于進(jìn)一步進(jìn)行生物活性研究。另外,NahK可以與其他兩種酶(Pasteurella multocida N-acetylglucosamine 1-phosphate uridylyltransferasepm, PmGlmUPasteurella multocida inorganic pyrophosphatase, PmPpA)結(jié)合使用,從而一鍋法合成UDP糖衍生物,大大簡化了合成過程[31]

6. NahK酶法合成GlcNAc/GalNAc-1-P衍生物

1.2    β-鍵構(gòu)型的糖-1-磷酸的合成
由于糖環(huán)端基的異構(gòu)效應(yīng),相比α-構(gòu)型,β-構(gòu)型的吡喃糖磷酸很不穩(wěn)定,所以其合成頗具挑戰(zhàn)性。前面介紹的方法都無法實現(xiàn)β-構(gòu)型的構(gòu)建,目前也很少有文獻(xiàn)報導(dǎo)β-鍵構(gòu)型的糖-1-磷酸的合成。Oberthür等人利用α-構(gòu)型糖基鹵化物和四丁胺鹽之間的SN2取代反應(yīng)合成了β-構(gòu)型2-脫氧糖磷酸(如圖7-I)[32]。他們發(fā)現(xiàn),更穩(wěn)定的異頭離去基團(tuán)有助于磷酸化反應(yīng)從SN1轉(zhuǎn)換為SN2路徑。同時,鄰近基團(tuán)的參與有助于磷酸化步驟中的立體控制。Timmons等人通過乙?;虮郊?span style="text-indent: 32px; line-height: 20px;">?;Wo(hù)的糖基溴化物和磷酸二芐酯的偶聯(lián),成功合成了β-L-巖藻糖/鼠李糖-1-磷酸(如圖7-II)[33]。

7. 化學(xué)合成β-連接的糖-1-P

Prihar等人用鄰亞苯基氯膦酸將甘露吡喃糖的半縮醛羥基磷酸化,得到β-D-甘露吡喃糖基-1-P[34]。同時,他們還使用MacDonald反應(yīng)獲得了β-α-L-巖藻呋喃糖-1-磷酸的混合物(β:α=12:5[35]。此外,酶促途徑也可以實現(xiàn)β-構(gòu)型糖-1-P
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